Wardūj är ett distrikt i Afghanistan. Det ligger i provinsen Badakhshan, i den nordöstra delen av landet, 300 kilometer nordost om huvudstaden Kabul.
Trakten runt Wardūj består i huvudsak av gräsmarker. Runt Wardūj är det glesbefolkat, med 11 invånare per kvadratkilometer. Inlandsklimat råder i trakten. Årsmedeltemperaturen i trakten är -4 °C. Den varmaste månaden är augusti, då medeltemperaturen är 12 °C, och den kallaste är januari, med -19 °C. Genomsnittlig årsnederbörd är 347 millimeter. Den regnigaste månaden är mars, med i genomsnitt 77 mm nederbörd, och den torraste är augusti, med 8 mm nederbörd.